Genômica comparativa de Ornithorhynchus anatinus revela genes mais próximos de tartarugas do que de outros mamíferos

O Ornithorhynchus anatinus, popularmente conhecido como ornitorrinco, é um mosaico de características por conter o bico semelhante ao de pato, a postura de ovos e a produção de leite sem a saída por mamilos. Ao comparar o seu proteoma com outros organismos, é possível investigar pistas da origem de seus genes e a proximidade deles de outros grupos. Dessa forma, o presente estudo tem como objetivo explorar a genômica comparativa do ornitorrinco, através da obtenção e análise de proteomas completos de organismos eucariontes. Para isso, foram utilizados 2.765 proteomas de referência obtidos do UniProt, incluindo o do ornitorrinco. O conjunto foi utilizado na construção de uma base de dados no software DIAMOND, e o proteoma do ornitorrinco foi alinhado utilizando a função BLASTp, com aplicação de diferentes faixas do parâmetro –top para análise do LCA dos genes mais similares aos dele. Os resultados indicaram que maior parte dos genes apresentaram como LCA a própria espécie, refletindo o efeito do self-score elevado. À medida que o intervalo top aumentou, observou-se que a incorporação de genes com ancestrais mais profundos, como a linhagem Gnathostomata. Além disso, a classe que reúne as tartarugas apresenta-se como a mais ocorrente para aqueles genes que tiveram hits contendo apenas o ornitorrinco como representante dos mamíferos. As análises de enriquecimento funcional desse subconjunto, bem como suas reconstruções filogenéticas, identificaram termos associados à formação da casca do ovo e confirmaram que as tartarugas são mais próximas do ornitorrinco para esse subconjunto, refletindo um caso potencial de homologia profunda e evidenciando a natureza mosaica do genoma dos monotremados.