Enterococcus faecalis CTF3 Fajının Karakterizasyonu ve Genom Özellikleri

Giriş: Enterokoklar, çok çeşitli çevresel ortamlarda bulunabilen, gram-pozitif, fırsatçı patojenlerdir.Bağışıklığı bozulmuş bireylerde septisemi, idrar yolu infeksiyonu, endokardit gibi pek çok infeksiyona yol açarlar ve tedavide kullanılan mevcut antibiyotiklere direnç geliştirmişlerdir.Alternatif tedavi yöntemlerinden birisi de bakteriyofaj (faj) tedavisidir.Çalışmamızın amacı, Enterococcus faecalis suşlarına karşı yeni litik bir fajın izole edilmesi ve genomik özelliklerinin belirlenmesidir.Materyal ve Metod: Bu çalışmada, E. faecalis ATCC 29212 suşuna karşı atık sulardan izole edilen E. faecalis fajı CTF3 çift tabaka agar yöntemi kullanılarak elde edilmiş, tüm genom dizilemesi yapılmış ve diğer Enterokok fajlarıyla karşılaştırılması araştırılmıştır.Bulgular: Bu çalışmada izole edilen E. faecalis CTF3 fajı, 40.215 baz çifti uzunluğunda ve dairesel (circular) yapıda tanımlanmıştır.Fajın genomunda toplam 63 adet yapısal protein belirlenmiştir.E. faecalis CTF3 fajının filogenetik yerleşimi ve taksonomik sınıflaması dikkate alındığında, izole edilen fajın Caudoviricetes sınıfına ve Efquatrovirus cinsine ait yeni bir Enterococcus fajı olabileceği sonucuna varılmaktadır.Sonuç: Nozokomiyal infeksiyon etkenlerinden E. faecalis'e karşı litik etkili, yeni bir faj atık sulardan izole edilmiş, tüm genom özellikleri karakterize edilmiştir.Çalışmadan elde edilen verilerin, gelecekteki faj tedavisi uygulamaları için hem faj kütüphanesi oluşturulmasına hem de klinikte kullanımı açısından klinisyenlere rehberlik edebileceği düşünülmektedir.