Seleção genômica ampla com algoritmo pseudo-metropolis-hastings em janelas cromossômicas

O trabalho propõe e avalia um novo método para seleção genômica ampla baseado em janelas cromossômicas, denominado algoritmo Pseudo-Metropolis-Hastings (Bin-PMH). Foi simulado um painel de SNPs(Single Nucleotide Polymorphism) genômicos de uma população F2 em com 10 grupos de ligação, a partir da qual foram simulados experimentos com dois cenários: um cenário oligogênico, com 10 SNPs assumindo papel de QTL, e um cenário poligênico, em que 20 SNPs foram considerados como QTL. O desempenho do modelo proposto foi comparado ao desempenho de métodos tradicionais (LASSO, rr-BLUP e Bayes B), considerando diferentes níveis de herdabilidade. O método divide o genoma em bins, realiza uma busca estocástica por um SNP representativo em cada janela e ajusta modelos LASSO em uma matriz de marcadores reduzida, o que melhora a resolução na detecção do sinal de QTL e a acurácia preditiva, sobretudo em herdabilidades baixa e média, indicando que o Bin-PMH pode ser uma alternativa promissora para seleção genômica.