Single-Nucleus RNA Sequencing Reveals Ferroptosis as a Potential Contributor to the Pathogenesis of Focal Cortical Dysplasia

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Authors: Qingyang Zeng
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Abstract

核RNA测序(snRNA-seq 6 ),组织学正常。数据采用统一流形近似与投影(UMAP)进行降维和可视化分析。鉴定出差异表达基因(DEGs),并接受了基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)途径富集分析。UCell评分和基因集富集分析(GSEA)被用于评估通路活性。通过免疫荧光验证了铁磷脂相关基因(FRGs)的表达水平,生化分析则定量了超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽(GSH)、丙二醛(MDA)和脂质过氧化物(LPO)的水平。共分析了170,747个细胞核,解析了5种主要细胞类型,包括抑制性神经元、兴奋性神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞和寡突胶质细胞。这些群体中的DEG在铁剥蚀和氧化应激相关通路中显著富集。UCell和GSEA强调了铁剥蚀、凋亡和氧化应激的显著变化,尤其是在抑制性神经元和星形胶质细胞方面。免疫荧光确认FCD组织中关键FRGs(包括FTL、FTH1、PCBP1、MAP1LC3B和PRNP)上调。同时,生化检测显示SOD和GSH水平降低,MDA和LPO水平升高,证实了转录和组织学发现。

Publication details

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Figshare
Publication date
1 January 2026
Document type
Dataset